要想杀虫效果好，杀虫时机的选择很重要。2014年在华中地区做的春季杀虫时间的调研结果为，4月2号之前杀虫的鱼塘寄生虫发病率是30%，而4月10日以后杀虫的鱼塘寄生虫发病率高达100%。
杀虫应当以水温为参考标准，当水温升高到18℃~20℃，天气保持连续3天以上的晴天时，就能够直接进行第一次杀虫。按照往年经验，这一段时间点华中华东地区一般是在3月下旬至4月初，华南地区一般在3月上中旬。
另外，在实际生产中，有经验的养殖户会根据天气和池塘情况来决定何时杀虫。在华中地区，每年的清明前后，脱掉外套穿单件衣服的时候，就需要杀虫了。或者观察池塘，当看到鱼吃食的时候“炸群”；有鱼在水表面不间断跳动、在岸边搅动水体或者狂游不止、身体打转失衡；晚上听到鱼拍打水面的声音；天气正常时鱼吃草量突然下降；白鲢翘尾巴等等；当看到这些现象时，就需要开始杀虫了。
许多养殖户很看重杀虫，结果虫害虽然好了，但鱼病很快又来了，为什么？杀虫后没有消毒是其中很重要的一个原因，因为这些虫主要寄生在鳃上，虫虽然杀了，但鳃已经受到一定损伤，此时细菌正好乘虚而入，很容易引起细菌性烂鳃，或生理性缺氧导致死亡。所以杀虫后一定要消毒；
建议在第二次杀虫后的第二天，使用聚维酮碘（10%，500毫升，一瓶1.5亩~2亩水体）进行全池消毒，在晴天的早晨消毒最佳。效果好、药性温和，而且挥发快，使用后开启增氧机。
很多养户杀过虫了，但是连续阴雨天后，天气转晴时，又会爆发寄生虫病，是因为天气变化，水温变化大会引起上下水层对流，带起池底的寄生虫卵进入水体孵化；泛底、倒藻导致有机物增加，给寄生虫提供繁殖的载体；温差大，鱼类应激大，易感染病原。因此，连续阴雨天转晴天时要补杀一次虫。
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